Вы, видимо, не совсем правильно поняли. Graphviz не умеет напрямую работать с корреляциями и т.д. Это всего-навсего программа визуализации. Т.е., чтобы эта программа что-то нарисовала, надо ей указать вручную, какие вершины с какими соединяются. В некоторых случаях эту процедуру можно автоматизировать.
Допустим у нас есть три вершины А B C, где каждая соединяется с каждой, тогда задание графа такого в программе Graphviz будет выглядеть следующим образом:
==============
Graph A
{
A--B
B--C
A--C
}
==============
Если хотите, можете прислать свои данные на адрес
pleiades@robotron.ru - можно будет здесь их, для примера, разобрать.